Lynn's Journey - BigQuery per l'analisi dei dati nel settore sanitario

"Aspettati di trascorrere il 20-25% del tuo tempo professionale per la durata della tua carriera."

Domande e risposte con Lynn

  • R: Tantissime! I miei servizi Google Cloud preferiti sono CloudRun, BigQuery, Dataproc. Gli strumenti preferiti sono l'editor di Cloud Shell, il browser SSH per Compute Engine e i dettagli di esecuzione di Big Query.
  • R: Mi piace usare lo strumento open source Variant Transforms per i file di dati VCF [o genomici]. Questo strumento permette ai bioinformatici di lavorare rapidamente con BigQuery. I ricercatori usano lo strumento VariantTransforms per convalidare e caricare i file VCF in BigQuery. VariantTransforms supporta i carichi di lavoro di analisi dei dati su scala genomica. Questi carichi di lavoro possono contenere centinaia di migliaia di file, milioni di campioni genomici e miliardi di record di input.
  • R: Lavoro con team di tutto il mondo per creare, scalare ed eseguire il deployment di più pipeline di dati su scala genomica per la salute umana. I casi d'uso recenti sono l'analisi di dati a supporto del Covid o dello sviluppo di farmaci antitumorali.
  • R. Prevedi di dedicare il 20-25% del tuo tempo professionale all'apprendimento per tutta la durata della tua carriera. Tutti i servizi cloud pubblici, incluso Google Cloud, sono in continua evoluzione. Per creare in modo efficace è necessario conoscere a fondo sia i pattern che i servizi cloud.

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