הפלט של צינורות עיבוד הנתונים (ETL) של FHIR Data Pipes הוא המרה של משאבי FHIR גולמיים לייצוג של הסכימה Parquet-on-FHIR. הפעולה הזו מתבצעת לכל סוג משאב בהתאם לכללי המיפוי של סכמת צינורות הנתונים של FHIR.
קובצי Parquet בעמודות שנוצרים מספקים את 'מרכז הנתונים הבסיסי', שאפשר להריץ עליו שאילתות באמצעות כלים שתומכים ב-Parquet (למשל, מנוע שאילתות שמבוסס על SQL) או לבצע בו טרנספורמציות נוספות דרך שכבת התצוגה לתצוגות מותמרות.