เอาต์พุตของ FHIR Data Pipes ETL Pipeline คือการเปลี่ยนรูปแบบทรัพยากร FHIR ดิบเป็นการแสดงสคีมา Parquet-on-FHIR ซึ่งจะดำเนินการกับทรัพยากรแต่ละประเภทและเป็นไปตามกฎการแมปสคีมาของ FHIR Data Pipes
ไฟล์ Parquet แบบคอลัมน์ที่สร้างขึ้นจะเป็น "ฐานข้อมูลคลังข้อมูล" ที่สามารถค้นหาได้โดยใช้เครื่องมือที่รองรับ Parquet (เช่น เครื่องมือค้นหาแบบ SQL) หรือเปลี่ยนรูปแบบเพิ่มเติมผ่านเลเยอร์มุมมองเป็นมุมมองที่แสดงผล