مشروع تحليل MD

تحتوي هذه الصفحة على تفاصيل مشروع كتابة تقنيّة تم قبوله في موسم المستندات من Google.

ملخص المشروع

المؤسسة المفتوحة المصدر:
MDAnalysis
الكاتب التقني:
الليمينيوم
اسم المشروع:
دليل مستخدم منظّم حسب الموضوع
مدة المشروع:
الجري الطويل (5 أشهر)

وصف المشروع

دليل لمكتبة MDAnasis، منفصل عن مرجع واجهة برمجة التطبيقات، والذي يتضمن:

  1. دليل مفصل حول هياكل البيانات المستخدمة في تحليل MD. سوف تقدم هذه الصفحة فئات Atom وAtomGroup وUniverse، وستتضمن خيارات وحدات الإدخال والإخراج، وتحتوي على معلومات حول معالجة Atom والجمع بين AtomGroups.

  2. صفحة عن الوحدات الأساسية لأداة "التحليل". تشكل وظائف فئة AnalysisBase وفئة AnalysisFromFunction وanalytics_class أساس أي تحليل يحدده المستخدم. ومن الجدير بالذكر ما تفعله كل فئة ضمن التفاصيل الداخلية، على سبيل المثال، ما إذا كانت تناظرية لـ numpy.frontize.

  3. صفحة حول اختيار مجموعات من الذرّات باستخدام Universe.select_atoms. كل من التفاصيل الفنية والمعرفة الجزيئية المعرفية التي تستند إليها طريقة تنفيذ هذه الطريقة.

  4. صفحة عن الطبولوجيات. يجب أن يفهم المستخدمون بنية البيانات واستخدامها ومعالجتها وإطارها الخاص بإنشاء أنظمة.

  5. صفحة عن طرق التمثيل المرئي المتاحة، سواء للمسار أو للتحليلات الحالية التي تعرض بيانات للتمثيل المرئي