Esta página contiene los detalles de un proyecto de redacción técnica aceptado para la temporada de Documentos de Google.
Resumen del proyecto
- Organización de código abierto:
- MDAnalysis
- Escritor técnico:
- lirios
- Nombre del proyecto:
- Una guía del usuario estructurada por tema
- Duración del proyecto:
- Larga duración (5 meses)
Project description
Una guía para la biblioteca de MDAnalysis, independiente de la referencia de la API, que incluye lo siguiente:
Una guía detallada sobre las estructuras de datos usadas en MDAnalysis. En esta página, se presentan las clases Atom, AtomGroup y Universe. Se incluirán opciones de E/S y se contendrá información sobre cómo manipular y combinar AtomGroups.
Una página sobre los componentes básicos de Análisis. Las funciones AnalysisBase, AnalysisFromFunction y analysis_class forman la base de cualquier análisis definido por el usuario. Vale la pena conocer qué hace cada clase de forma interna, p.ej., si es similar a numpy.vectorize.
Una página sobre cómo seleccionar grupos de átomos con Universe.select_atoms. Los detalles técnicos y el conocimiento de la dinámica molecular detrás de la implementación de esta estrategia.
Una página sobre topologías. Los usuarios deben comprender la estructura de datos, el uso, la manipulación y el framework para crear sistemas.
Es una página sobre los métodos de visualización disponibles, tanto para la trayectoria como para los análisis actuales que devuelven datos para su visualización.