این صفحه حاوی جزئیات یک پروژه نگارش فنی است که برای فصل اسناد Google پذیرفته شده است.
خلاصه پروژه
- سازمان منبع باز:
- MDA Analysis
- نویسنده فنی:
- لیلیمینیوم
- نام پروژه:
- یک راهنمای کاربر که بر اساس موضوع ساختار یافته است
- طول پروژه:
- دویدن طولانی مدت (5 ماه)
شرح پروژه
راهنمای کتابخانه MDAanalysis، جدا از مرجع API، که شامل:
راهنمای دقیق برای ساختارهای داده مورد استفاده در MDAanalysis. این صفحه کلاس های Atom، AtomGroup و Universe را معرفی می کند. شامل گزینه های I/O و حاوی اطلاعاتی در مورد دستکاری اتم ها و ترکیب AtomGroups است.
صفحه ای در مورد بلوک های ساختمان تجزیه و تحلیل. کلاس AnalysisBase، کلاس AnalysisFromFunction و توابع analysis_class اساس هر تحلیل تعریف شده توسط کاربر را تشکیل می دهند. کاری که هر کلاس در زیر کاپوت انجام می دهد ارزشمند است، به عنوان مثال اگر شبیه numpy.vectorize باشد.
صفحه ای در مورد انتخاب گروه های اتم با استفاده از Universe.select_atoms. هم جزئیات فنی و هم دانش دینامیک مولکولی در پس روشی که این کار اجرا می شود.
صفحه ای در مورد توپولوژی ها کاربران باید ساختار داده، استفاده، دستکاری و چارچوب سیستم های ساختمانی را درک کنند.
صفحه ای در مورد روش های تجسم موجود، هم برای مسیر و هم برای تحلیل های فعلی که داده ها را برای تجسم برمی گرداند.