Esta página contém os detalhes de um projeto de escrita técnica aceito para o Temporada dos Documentos Google.
Resumo do projeto
- Organização de código aberto:
- MDAnalysis
- Redator técnico:
- lírio
- Nome do projeto:
- Um guia do usuário estruturado por tópico
- Duração do projeto:
- Longa duração (cinco meses)
Project description
Um guia da biblioteca MDAnalysis, separado da referência da API, que inclui:
Um guia detalhado sobre as estruturas de dados usadas na MDAnalysis. Esta página vai apresentar as classes Atom, AtomGroup e Universe, incluir opções de E/S e conter informações sobre como manipular átomos e combinar AtomGroups.
Uma página sobre os elementos básicos do Analysis. As classes AnalysisBase, AnalysisFromFunction e analysis_class formam a base de qualquer análise definida pelo usuário. Vale a pena saber o que cada classe faz, por exemplo, se ela é análoga a numpy.vectorize.
Uma página sobre como selecionar grupos de átomos usando Universe.select_atoms. Tanto os detalhes técnicos quanto o conhecimento sobre dinâmica molecular por trás da implementação.
Uma página sobre topologias. Os usuários precisam entender a estrutura, o uso, a manipulação e a estrutura de dados para a construção de sistemas.
Uma página sobre os métodos de visualização disponíveis, tanto para a trajetória quanto para as análises atuais que retornam dados para visualização.