โครงการ MDAnalysis

หน้านี้มีรายละเอียดของโครงการการเขียนเชิงเทคนิคที่ยอมรับสำหรับ Google Season of Docs

ข้อมูลสรุปของโปรเจ็กต์

องค์กรโอเพนซอร์ส:
MDAnalysis
ผู้เขียนด้านเทคนิค:
ลิลิมิเนียม
ชื่อโปรเจ็กต์:
คู่มือผู้ใช้ที่มีโครงสร้างตามหัวข้อ
ระยะเวลาของโปรเจ็กต์:
วิ่งเป็นเวลานาน (5 เดือน)

คำอธิบายโปรเจ็กต์

คู่มือเกี่ยวกับไลบรารี MDAnalysis แยกต่างหากจากข้อมูลอ้างอิง API ซึ่งประกอบด้วย

  1. คำแนะนำโดยละเอียดเกี่ยวกับโครงสร้างข้อมูลที่ใช้ใน MDAnalysis หน้านี้จะแนะนำคลาส Atom, AtomGroup และ Universe ซึ่งมีตัวเลือก I/O และมีข้อมูลเกี่ยวกับการบิดเบือน Atoms และการรวม AtomGroups

  2. หน้าบนองค์ประกอบพื้นฐานสำหรับการวิเคราะห์ คลาส AnalysisBase, คลาส AnalysisFromFunction และ Analysis_class เป็นพื้นฐานของการวิเคราะห์ที่ผู้ใช้กําหนด สิ่งที่แต่ละชั้นทำเบื้องหลังเป็นสิ่งที่คุ้มค่า เช่น การเปรียบเทียบกับ numpy.vectorize

  3. หน้าเกี่ยวกับการเลือกกลุ่มของอะตอมโดยใช้ Universe.select_atoms ทั้งรายละเอียดทางเทคนิคและความรู้เรื่องพลวัตระดับโมเลกุลที่อยู่เบื้องหลังวิธีการนำโซลูชันนี้ไปใช้

  4. หน้าเกี่ยวกับโทโพโลยี ผู้ใช้ควรเข้าใจโครงสร้างข้อมูล การใช้งาน การบิดเบือน และเฟรมเวิร์กสำหรับการสร้างระบบ

  5. หน้าเกี่ยวกับวิธีการแสดงข้อมูลผ่านภาพที่ใช้ได้ ทั้งสําหรับวิถีและการวิเคราะห์ปัจจุบันซึ่งแสดงผลข้อมูลสำหรับการแสดงภาพ