โครงการ MDAnalysis

หน้านี้มีรายละเอียดโครงการงานเขียนเชิงเทคนิคที่ได้รับการยอมรับใน Google Season of เอกสาร

สรุปโปรเจ็กต์

องค์กรโอเพนซอร์ส
MDAnalysis
นักเขียนเชิงเทคนิค
lilyminium
ชื่อโปรเจ็กต์:
คู่มือผู้ใช้ที่มีโครงสร้างตามหัวข้อ
ระยะเวลาของโปรเจ็กต์
ใช้งานนาน (5 เดือน)

คำอธิบายโปรเจ็กต์

คำแนะนำเกี่ยวกับไลบรารี MDAnalysis ซึ่งแยกจากข้อมูลอ้างอิง API ซึ่งประกอบด้วย

  1. คู่มือโดยละเอียดเกี่ยวกับโครงสร้างข้อมูลที่ใช้ใน MDAnalysis หน้านี้จะแนะนำคลาส Atom, AtomGroup และ Universe ซึ่งประกอบไปด้วยตัวเลือก I/O และมีข้อมูลเกี่ยวกับการจัดการ Atoms และการรวม AtomGroups

  2. หน้าเกี่ยวกับองค์ประกอบพื้นฐานของการวิเคราะห์ คลาส AnalysisBase, คลาส AnalysisFromFunction และฟังก์ชัน analysis_class เป็นพื้นฐานของการวิเคราะห์ที่ผู้ใช้กําหนด คุณควรทราบสิ่งที่แต่ละคลาสทําอยู่เบื้องหลัง เช่น ในกรณีที่คล้ายกับ numpy.vectorize

  3. หน้าเกี่ยวกับการเลือกกลุ่มของอะตอมโดยใช้ Universe.select_atoms ทั้งรายละเอียดทางเทคนิคและความรู้ด้านโมเลกุลไดนามิกที่อยู่เบื้องหลังวิธีการใช้งาน

  4. หน้าเกี่ยวกับโทโพโลยี ผู้ใช้ควรเข้าใจโครงสร้างข้อมูล การใช้งาน การจัดการ และเฟรมเวิร์กสำหรับการสร้างระบบ

  5. หน้าเกี่ยวกับวิธีการแสดงภาพที่ใช้ได้ ทั้งสำหรับวิถีโคจรและการวิเคราะห์ปัจจุบันที่แสดงผลข้อมูลสำหรับการแสดงภาพ