Bu sayfa, Google Dokümanlar Sezonu için kabul edilen bir teknik yazı projesinin ayrıntılarını içerir.
Proje özeti
- Açık kaynak kuruluşu:
- MDAnalysis
- Teknik yazar:
- lilyminyum
- Projenin adı:
- Konuya göre yapılandırılmış kullanıcı rehberi
- Proje süresi:
- Uzun süreli (5 ay)
Proje açıklaması
API referansından ayrı olarak MDAnalysis kitaplığı için hazırlanmış, aşağıdakileri içeren bir kılavuz:
MDAnalysis'te kullanılan veri yapıları için ayrıntılı bir kılavuz. Bu sayfa Atom, AtomGroup ve Universe sınıflarını tanıtacak, G/Ç seçeneklerini içerecek ve Atom'ları değiştirme ve AtomGroups'u birleştirme hakkında bilgiler içerecektir.
Analysis yapı taşlarının üzerindeki bir sayfa. AnalysisBase sınıfı, AnalysisFromFunction sınıfı ve Analysis_class işlevleri, kullanıcı tanımlı tüm analizlerin temelini oluşturur. Her sınıfın işin mutfağında ne yaptığını bilmekte fayda var, örneğin, numpy.Vektörize etmek için kullanılan yöntem benzer mi?
Universe.select_atoms kullanarak atom gruplarını seçmeyle ilgili bir sayfa. Bunun uygulanma şeklinin hem teknik ayrıntılar hem de moleküler dinamikler hakkındaki bilgisi.
Topolojiler hakkında bir sayfa. Kullanıcıların sistemler arasındaki veri yapısını, kullanımını, manipülasyonunu ve çerçevesini anlamaları gerekir.
Hem gidişat hem de görselleştirme amacıyla veri döndüren mevcut analizler için kullanılabilecek görselleştirme yöntemlerinin yer aldığı bir sayfa.