MDAnalysis 项目

本页面包含有关 Google 文档季可接受的技术写作项目的详细信息。

项目摘要

开源组织:
MDAnalysis
技术文档工程师:
lilyminium
项目名称:
按主题整理的用户指南
项目时长:
长期投放(5 个月)

Project description

独立于 API 参考文档的 MDAnalysis 库指南,其中包含以下内容:

  1. MDAnalysis 中使用的数据结构的详细指南。本页将介绍 Atom、AtomGroup 和 Universe 类;包含 I/O 选项,并包含有关操作 Atom 和组合 AtomGroup 的信息。

  2. “分析”基础组件的页面。AnalysisBase 类、AnalysisFromFunction 类和 analytics_class 函数是任何用户定义的分析的基础。每个类在后台执行的操作值得了解,例如,它是否类似于 numpy.vectorize。

  3. 介绍如何使用 Universe.select_atoms 选择原子组的页面。实现此功能所需的技术细节以及分子动力学知识。

  4. 关于拓扑的页面。用户应该了解构建系统的数据结构、用法、操作和框架。

  5. 此页面介绍了可用的可视化方法,包括轨迹和当前分析(可返回可视化数据)。