MDAnalysis 專案

本頁針對 Google 系列文件接受的技術撰寫專案提供詳細資料。

專案摘要

開放原始碼機構:
MDAnalysis
技術文件撰寫者:
lilyminium
專案名稱:
依主題分類的使用者指南
專案長度:
長時間執行 (5 個月)

Project description

與 API 參考資料不同的 MDAnalysis 程式庫指南,內容包括:

  1. MDAnalysis 中所用資料結構的詳細指南。本頁面將介紹 Atom、AtomGroup 和 Universe 類別 (包含 I/O 選項),並提供操控 Atom 及組合 AtomGroup 的資訊。

  2. 分析構成元素的網頁。AnalysisBase 類別、AnalyzeFromFunction 類別和 analyze_class 函式構成任何使用者定義的分析的基礎。每個類別實際上都值得瞭解,舉例來說,如果與 numpy.vectorize 類似,

  3. 說明使用 Universe.select_atoms 選取原子群組的網頁。實作方式背後的技術細節和分子動態知識。

  4. 拓撲頁面。使用者應瞭解建構系統的資料結構、使用方式、操控和架構,

  5. 顯示可用圖表方法的頁面,其中適用於軌跡和目前會傳回視覺化資料等分析的分析。