Projet NRNB

Cette page contient les détails d'un projet de rédaction technique accepté pour la Google Season of Docs.

Résumé du projet

Organisation Open Source:
National Resource for Network Biology (NRNB) (en anglais)
Rédacteur technique:
kozo2
Nom du projet:
Remplacement des tutoriels de contrôle de l'IUG par des tutoriels sur Jupyter Notebook et R Markdown
Durée du projet:
Durée standard (trois mois)

Project description

Les tutoriels disponibles sur https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki sont excellents, mais la plupart d'entre eux sont basés sur une IUG et ne sont pas automatisés en Python ou en R.

Je vais écrire le contenu des tutoriels Cytoscape en Python et en R dans la mesure du possible, et créer le site de la galerie de notebooks Jupyter et de R Markdown. La conception de ces sites ressemblera à https://plot.ly/ipython-notebooks/ et https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html.

Pour assurer la cohérence du nouveau contenu, j'utiliserai des services de CI et https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (c'est-à-dire que j'automatiserai l'exécution du notebook Jupyter et de R Markdown).