פרויקט NRNB

בדף הזה מפורטים פרטי פרויקט של כתיבה טכנית שאושר להשתתפות בתוכנית Google Season of Docs.

סיכום הפרויקט

ארגון קוד פתוח:
המשאב הלאומי לביולוגיה של הרשת (NRNB)
כותבים טכניים:
kozo2
שם הפרויקט:
החלפת מדריכים של פקדי GUI ל-Jupyter Notebook ו-R Markdown
אורך הפרויקט:
אורך סטנדרטי (3 חודשים)

תיאור הפרויקט

המדריכים בכתובת https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki מצוינים, אבל רובם מבוססים על ממשק משתמש גרפי ולא אוטומטיים ב-Python או ב-R.

אכתוב את התוכן של מדריכי Cytoscape ב-Python וב-R ככל האפשר, ואצור את האתר של Jupyter Notebook ושל גלריית R Markdown. העיצוב של האתרים האלה יהיה דומה לזה של https://plot.ly/ipython-notebooks/ ו-https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html.

כדי לשמור על עקביות התוכן החדש, אשתמש בשירותי CI וב-https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (כלומר, הפעלה אוטומטית של Jupyter Notebook ו-R Markdown).