Project NRNB

Halaman ini berisi detail project penulisan teknis yang diterima untuk Google Season of Docs.

Ringkasan project

Organisasi open source:
National Resource for Network Biology (NRNB)
Penulis teknis:
kozo2
Nama project:
Mengganti tutorial kontrol GUI ke Jupyter Notebook dan R Markdown
Durasi project:
Durasi standar (3 bulan)

Project description

Tutorial di https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki sangat bagus, tetapi sebagian besar berbasis GUI dan tidak otomatis di Python atau R.

Saya akan menulis konten tutorial Cytoscape dalam Python dan R sebanyak mungkin, serta membuat situs galeri Jupyter Notebook dan R Markdown. Desain situs tersebut akan terlihat seperti https://plot.ly/ipython-notebooks/ dan https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html.

Untuk mempertahankan konsistensi konten baru, saya akan menggunakan layanan CI dan https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (yaitu mengotomatiskan Jupyter Notebook dan R Markdown).