NRNB プロジェクト

このページでは、Google Season of Docs に承認された技術文書作成プロジェクトの詳細について説明します。

プロジェクトの概要

オープンソース組織:
National Resource for Network Biology(NRNB)
テクニカル ライター:
kozo2
プロジェクト名:
GUI コントロール チュートリアルを Jupyter Notebook と R Markdown に置き換え
プロジェクトの長さ:
標準期間(3 か月)

プロジェクトの説明

https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki のチュートリアルは優れていますが、ほとんどが GUI ベースで、Python や R で自動化されていません。

Cytoscape チュートリアルの内容は、できるだけ Python と R の両方で記述し、Jupyter Notebook と R Markdown のギャラリー サイトを作成します。これらのサイトのデザインは、https://plot.ly/ipython-notebooks/https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html のようになります。

新しいコンテンツの一貫性を維持するため、CI サービスと https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop を使用します(つまり、Jupyter Notebook と R Markdown の実行を自動化します)。