projekt NRNB

Ta strona zawiera szczegółowe informacje na temat projektu technicznego przyjęta do programu Sezon Dokumentów Google.

Podsumowanie projektu

Organizacja open source:
National Resource for Network Biology (NRNB)
Pisarz techniczny:
kozo2
Nazwa projektu:
Zastąpienie samouczków sterowania interfejsem GUI na notatnik Jupyter i R Markdown
Długość projektu:
Standardowa długość (3 miesiące)

Opis projektu

Samouczki dostępne pod adresem https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki są świetne, ale większość z nich opiera się na graficznym interfejsie użytkownika i nie jest zautomatyzowany w języku Python czy R.

Będę jak najczęściej pisać samouczki Cytoscape w języku Python i R, a także utworzę witrynę notatnika Jupyter i galerię R Markdown. Projekty tych witryn będą wyglądać tak: https://plot.ly/ipython-notebooks/ i https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html.

Aby zachować spójność nowych treści, użyję usług CI i https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (tj. zautomatyzuję uruchamianie notatnika Jupyter i R Markdown).