โครงการ NRNB

หน้านี้มีรายละเอียดของโครงการการเขียนเชิงเทคนิคที่ยอมรับสำหรับ Google Season of Docs

ข้อมูลสรุปของโปรเจ็กต์

องค์กรโอเพนซอร์ส:
ทรัพยากรชีววิทยาเครือข่าย (National Resource for Network Biology หรือ NRNB)
ผู้เขียนด้านเทคนิค:
kozo2
ชื่อโปรเจ็กต์:
แทนที่บทแนะนำการควบคุม GUI เป็น Jupyter Notebook และ R Markdown
ระยะเวลาของโปรเจ็กต์:
ระยะเวลามาตรฐาน (3 เดือน)

คำอธิบายโปรเจ็กต์

บทแนะนำใน https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki มีประสิทธิภาพดี แต่ส่วนใหญ่เป็นแบบ GUI และไม่ได้ทำงานอัตโนมัติใน Python หรือ R

ผมจะเขียนเนื้อหาบทแนะนำเกี่ยวกับ Cytoscape ทั้งใน Python และ R ให้มากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ และสร้างเว็บไซต์แกลเลอรี Jupyter Notebook และ R Markdown การออกแบบเว็บไซต์เหล่านั้นจะมีลักษณะเป็น https://plot.ly/ipython-notebooks/ และ https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html

เพื่อให้เนื้อหาใหม่สอดคล้องกัน เราจะใช้บริการ CI และ https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (เช่น เรียกใช้ Jupyter Notebook และ R Markdown โดยอัตโนมัติ)