หน้านี้มีรายละเอียดโครงการงานเขียนเชิงเทคนิคที่ได้รับการยอมรับใน Google Season of เอกสาร
สรุปโปรเจ็กต์
- องค์กรโอเพนซอร์ส
- แหล่งข้อมูลชีววิทยาเครือข่ายแห่งชาติ (NRNB)
- นักเขียนเชิงเทคนิค
- kozo2
- ชื่อโปรเจ็กต์:
- แทนที่บทแนะนำการควบคุม GUI เป็น Jupyter Notebook และ R Markdown
- ระยะเวลาของโปรเจ็กต์
- ระยะเวลามาตรฐาน (3 เดือน)
คำอธิบายโปรเจ็กต์
บทแนะนำที่ https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki นั้นยอดเยี่ยม แต่ส่วนใหญ่จะอิงตาม GUI และไม่เป็นแบบอัตโนมัติใน Python หรือ R
เราจะเขียนเนื้อหาของบทแนะนำ Cytoscape ทั้งภาษา Python และ R ให้ได้มากที่สุด รวมถึงสร้างเว็บไซต์แกลเลอรี Jupyter Notebook และ R Markdown การออกแบบของเว็บไซต์เหล่านั้นจะมีลักษณะเหมือนกับ https://plot.ly/ipython-notebooks/ และ https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html
ฉันจะใช้บริการ CI และ https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop เพื่อให้เนื้อหาใหม่มีความสอดคล้องกัน (เช่น การเรียกใช้ Jupyter Notebook และ R Markdown โดยอัตโนมัติ)