NRNB 專案

本頁針對 Google 系列文件接受的技術撰寫專案提供詳細資料。

專案摘要

開放原始碼機構：

國家網路生物學資源 (NRNB)

技術文件撰寫者：

kozo2

專案名稱：

將 GUI 控制教學課程取代為 Jupyter Notebook 和 R Markdown

專案長度：

標準長度 (3 個月)

Project description

https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki 提供的教學課程非常好，但大部分的教學課程都是以 GUI 為基礎，並未以 Python 或 R 為基礎進行自動化。

我會盡量使用 Python 和 R 編寫 Cytoscape 教學課程的內容，以及讓 Jupyter Notebook 和 R Markdown 圖庫網站。 這類網站的設計應如下所示：https://plot.ly/ipython-notebooks/ 和 https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html。

為了維持新內容的一致性，我將使用持續整合服務和 https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (也就是自動執行 Jupyter Notebook 和 R Markdown)。