Dự án MDAnalysis

Trang này chứa thông tin chi tiết về một dự án viết kỹ thuật được chấp nhận cho Phần Google Tài liệu.

Tóm tắt dự án

Tổ chức nguồn mở:
MDAnalysis
Người viết nội dung kỹ thuật:
hoa lily
Tên dự án:
Hướng dẫn sử dụng được cấu trúc theo chủ đề
Thời lượng dự án:
Lâu dài (5 tháng)

Mô tả dự án

Hướng dẫn về thư viện MDAnalysis, tách biệt với tài liệu tham khảo API, bao gồm:

  1. Hướng dẫn chi tiết về các cấu trúc dữ liệu dùng trong MDAnalysis. Trang này sẽ giới thiệu các lớp Atom, AtomGroup và Unse; bao gồm các tuỳ chọn I/O và chứa thông tin về việc thao tác các Atom và kết hợp các AtomGroups.

  2. Một trang trong các thành phần của công cụ Phân tích. Lớp AnalysisBase, lớp AnalysisFromFunction và các hàm Analysis_class tạo thành cơ sở của bất kỳ phân tích nào do người dùng xác định. Những gì mỗi lớp thực hiện nâng cao là đáng để biết, ví dụ: nếu nó tương tự như numpy. vectorize.

  3. Một trang về cách chọn nhóm nguyên tử bằng cách sử dụng Unse.select_atoms. Cả chi tiết kỹ thuật và kiến thức động học phân tử đằng sau cách thức triển khai này.

  4. Một trang về cấu trúc liên kết. Người dùng cần nắm được cấu trúc dữ liệu, cách sử dụng, thao tác và khung dữ liệu dành cho hệ thống xây dựng.

  5. Một trang về các phương pháp trực quan hoá có sẵn, cho cả quỹ đạo và các bản phân tích hiện tại (có trả về dữ liệu để trực quan hoá).