Dự án NRNB

Trang này chứa thông tin chi tiết về một dự án viết nội dung kỹ thuật đã được chấp nhận tham gia Google Season of Docs.

Tóm tắt dự án

Tổ chức nguồn mở:
Tài nguyên quốc gia về sinh học mạng (NRNB)
Người viết nội dung kỹ thuật:
kozo2
Tên dự án:
Thay thế hướng dẫn điều khiển GUI cho Jupyter Notebook và R Markdown
Thời lượng dự án:
Thời gian tiêu chuẩn (3 tháng)

Mô tả dự án

Các hướng dẫn tại https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki rất hữu ích nhưng hầu hết đều dựa trên GUI và không tự động hoá trong Python hoặc R.

Tôi sẽ viết nội dung của các hướng dẫn về Cytoscape bằng cả Python và R càng nhiều càng tốt, đồng thời tạo trang web thư viện Jupyter Notebook và R Markdown. Thiết kế của các trang web đó sẽ giống như https://plot.ly/ipython-notebooks/https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html.

Để duy trì tính nhất quán của nội dung mới, tôi sẽ sử dụng dịch vụ CI và https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (tức là tự động chạy Jupyter Notebook và R Markdown).