Trang này chứa thông tin chi tiết về một dự án viết kỹ thuật được chấp nhận cho Phần Google Tài liệu.
Tóm tắt dự án
- Tổ chức nguồn mở:
- Tài nguyên quốc gia về sinh học mạng (NRNB)
- Người viết nội dung kỹ thuật:
- kozo2
- Tên dự án:
- Thay thế phần hướng dẫn điều khiển GUI vào Jupyter Notebook và R Markdown
- Thời lượng dự án:
- Thời gian tiêu chuẩn (3 tháng)
Mô tả dự án
Các hướng dẫn tại https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki rất tuyệt vời nhưng hầu hết đều dựa trên GUI (Giao diện người dùng đồ hoạ) và không được tự động hoá bằng Python hoặc R.
Tôi sẽ viết nhiều nhất có thể nội dung hướng dẫn về Cytoscape bằng cả Python và R, đồng thời tạo trang web thư viện Jupyter và R Markdown. Thiết kế của các trang web đó sẽ có dạng https://plot.ly/ipython-notebooks/ và https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html.
Để đảm bảo tính nhất quán của nội dung mới, tôi sẽ sử dụng các dịch vụ CI và https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (tức là tự động chạy Jupyter Notebook và R Markdown).